Há sete níveis mutantes no universo Marvel. Zeta é o mais baixo deles, pois não se trata necessariamente de poderes mutantes, mas sim de seres humanos cujos filhos ou netos podem acabar sofrendo alterações genéticas.

Em alguns casos, a pessoa apenas suporta o gene x. Em outros, eles podem ter filhos com o gene. Seja qual for o caso, o consenso é que eles não têm poderes mutantes.

Mutantes de nível Epsilon são aqueles sem habilidades especiais, mas que possuem uma mutação que afeta sua vida de maneira extremamente negativa. Vários mutantes deste nível acabaram mortos por possuírem aparências não tão agradáveis aos olhos. Apenas 20% dos mutantes se enquadram nesta categoria.

Embora suas mutações não sejam tão prejudiciais, eles também não são muito poderosos. Mutantes de nível Delta são os que mais se parecem com seres humanos comuns. Em geral, os Delta possuem habilidades e sentidos humanos amplificados.

Entretanto, isso não é regra. Indivíduos com poderes específicos também podem ser classificados aqui, juntamente com suas habilidades secundarias.

Os Delta representam cerca de 50% dos mutantes. Eles podem ter muitos tipos de poderes, como Forge (que tem o poder de inventar coisas), Loa (que pode passar através de objetos sólidos, fazendo com que eles se separem), ou Wallflower (que controla os feromônios).

Mutantes de nível Gamma possuem uma mutação fisicamente prejudicial, mesmo que suas formidáveis habilidades sejam de alto nível. Muitas vezes, esses mutantes são incapazes de se misturar na multidão de humanos, o que os impossibilita de uma vida normal.

Alguns personagens, como a Medula, têm mutações muito pequenas que lhes causam dor constante e tonam suas aparências desumanas. Enquanto outros, como Blob, têm habilidades bastante impressionantes, mas o fato de ser um obeso mórbido, em decorrência da sua mutação, faz com que sua vida seja muito difícil.

Mutantes de nível beta são seres tão poderosos quanto os Alfa, mas fazem parte de uma minoria prejudicada por um aspecto de sua mutação em um nível menor. Estas desvantagens podem ser qualquer coisa, desde características físicas ligeiramente anormais, como no caso do Gambit que possui o globo ocular preto, até a incapacidade de ligar ou desligar seus poderes à vontade.

Existem mutações mais visíveis que podem ser facilmente identificadas como Beta. Alguns exemplos são o Fera, Mística e Noturno. Por vezes, o Wolverine foi enquadrado neste nível.

A Vampira costumava ser um membro desta classe, uma vez que não era capaz de fazer contato físico com a maioria dos outros seres vivos. Entretanto, com a evolução de seus poderes, ela se tornou uma mutante Alfa.

Os Mutantes de nível alfa representam 10% da população mutante. Suas mutações não apresentam desvantagens significativas e não são muito prejudicados por sua própria mutação, mesmo que possam possuir outras deficiências.
Os nível Alfa geralmente têm controle total sob seus poderes e conseguem liga-los e desliga-los à vontade.

Bons exemplos desta classe de mutantes são Magneto, Tempestade, Emma Frost e Vampira. Este nível também engloba personagens com habilidades que são consideradas mais poderosas do que as pessoas com mutações negativas, portanto, abrange uma gama muito mais ampla de membros.

Para um personagem se qualificar como um mutante nível Omega, é tecnicamente necessário que ele seja oficialmente rotulado como tal. Existem traços específicos que os mutantes de nível Omega devem possuir. Como habilidades de mudar o estado de seu corpo físico ou possuir energia psíquica. Algo comum entre os mutantes desta classe são habilidades destrutivas. Mutantes Ômegas são extremamente raros e poucos são conhecidos no universo Marvel. Seja por coincidência ou design, a maioria deles são telepatas, visto que telepatia é um poder Ômega. Entretanto, nem todo telepata é, necessariamente, um mutante Ômega.

Exemplos de mutantes que foram confirmados como de nível Ômega incluem Jean Grey, Kid Ômega, Vulcano, Esperança Summers, Absolon Mercator, Homem de Gelo, Legião, Elixir, Franklin Richards, Gabriel Shepherd, Decimus Furius, Apocalipse, entre outros. Também existem os mutantes potencialmente Ômega, cujos poderes se aproximam do nível Ômega, mas raramente se expressam.